Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms