Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubl3Q9Z2M6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubl3Q9Z2M6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms