Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ap3b1Q9Z1T1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Ap3b1Q9Z1T1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ap3b1Q9Z1T1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms