Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx39bQ9Z1N5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx39bQ9Z1N5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms