Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d3Q9Z1L5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms