Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L4

Rs1, Retinoschisin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rs1Q9Z1L4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rs1Q9Z1L4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms