Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syngr4Q9Z1L2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr4Q9Z1L2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr4Q9Z1L2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms