Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmg20bQ9Z104 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Hmg20bQ9Z104 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms