Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp2Q9Z0E6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms