Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pmfbp1Q9WVQ0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pmfbp1Q9WVQ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pmfbp1Q9WVQ0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms