Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme4Q9WV84 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nme4Q9WV84 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme4Q9WV84 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms