Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnip1Q9WUU8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnip1Q9WUU8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms