Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ClcnkbQ9WUB6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClcnkbQ9WUB6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms