Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul1Q9WTX6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul1Q9WTX6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul1Q9WTX6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms