Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp18Q9WTV6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp18Q9WTV6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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