Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vax2Q9WTP9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax2Q9WTP9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms