Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hic1Q9R1Y5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hic1Q9R1Y5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hic1Q9R1Y5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms