Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf103Q9R1W3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf103Q9R1W3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms