Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubd1Q9R1K7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubd1Q9R1K7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms