Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Taf7Q9R1C0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Taf7Q9R1C0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Taf7Q9R1C0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Taf7Q9R1C0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Taf7Q9R1C0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Taf7Q9R1C0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Taf7Q9R1C0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Taf7Q9R1C0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Taf7Q9R1C0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms