Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcm1Q9R0L6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcm1Q9R0L6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcm1Q9R0L6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms