Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plod1Q9R0E2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plod1Q9R0E2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod1Q9R0E2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171 ms