Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms