Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod3Q9R0E1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms