Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prkab1Q9R078 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkab1Q9R078 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkab1Q9R078 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms