Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fhl3Q9R059 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms