Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp11cQ9QZW0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp11cQ9QZW0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms