Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ripk3Q9QZL0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ripk3Q9QZL0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms