Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClnkQ9QZE2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClnkQ9QZE2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191 ms