Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Exo1Q9QZ11 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Exo1Q9QZ11 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Exo1Q9QZ11 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Exo1Q9QZ11 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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