Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Rdh11Q9QYF1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rdh11Q9QYF1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rdh11Q9QYF1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Rdh11Q9QYF1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Rdh11Q9QYF1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Rdh11Q9QYF1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdh11Q9QYF1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Rdh11Q9QYF1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdh11Q9QYF1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdh11Q9QYF1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdh11Q9QYF1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Rdh11Q9QYF1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh11Q9QYF1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh11Q9QYF1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh11Q9QYF1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rdh11Q9QYF1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Rdh11Q9QYF1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rdh11Q9QYF1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
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Rdh11Q9QYF1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh11Q9QYF1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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