Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd1Q9QY80 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd1Q9QY80 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms