Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk1nQ9QXV0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcsk1nQ9QXV0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcsk1nQ9QXV0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms