Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apbb1Q9QXJ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apbb1Q9QXJ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apbb1Q9QXJ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apbb1Q9QXJ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apbb1Q9QXJ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apbb1Q9QXJ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apbb1Q9QXJ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apbb1Q9QXJ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apbb1Q9QXJ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apbb1Q9QXJ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apbb1Q9QXJ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Apbb1Q9QXJ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms