Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyhr1Q9QXA1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cyhr1Q9QXA1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyhr1Q9QXA1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms