Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc4Q9QUQ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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