Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cln8Q9QUK3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms