Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PolkQ9QUG2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PolkQ9QUG2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolkQ9QUG2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms