Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk1eQ9JMK2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csnk1eQ9JMK2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms