Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PnkpQ9JLV6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PnkpQ9JLV6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms