Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cabp1Q9JLK7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Cabp1Q9JLK7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Cabp1Q9JLK7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cabp1Q9JLK7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cabp1Q9JLK7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms