Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr5Q9JLF7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms