Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TefQ9JLC6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TefQ9JLC6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TefQ9JLC6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms