Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CtsmQ9JL96 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtsmQ9JL96 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms