Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bace2Q9JL18 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms