Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf3Q9JKL4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf3Q9JKL4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 715.3 ms