Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms