Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl39Q9JKF7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms