Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms