Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog8Q9JJA2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog8Q9JJA2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms