Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmod3Q9JHJ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmod3Q9JHJ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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